Supports de cours

Cette page recense des supports de formation en (bio)statistique mis à votre disposition par les animateurs/trices de la plateforme de biostatistique de Toulouse.

Introduction à la statistique

• supports de cours pour « Introduction à la statistique (formation annuelle PF biostat, Sébastien Déjean, Nathalie Vialaneix et Sandrine Laguerre)

Statistique générale

• statistique exploratoire multidimensionnelle (classification ascendante hiérarchique, k-moyennes, ACP, AFD, AFC, régression linéaire multiple) (Sébastien Déjean)

• tutoriel de recommandation pour le modèle mixte sous R(Laurent Cauquil et Sylvie Combes, juin 2018)

• supports de cours pour “inférence et analyse de réseaux”" (formation PF biostatistique, Nathalie Vialaneix), avec, en particulier, la vignette

• supports de cours pour “apprentissage statistique” (formation PF biostatistique, Nathalie Vialaneix)

• supports de cours pour “statistique avancée”" (formation PF biostatistique, Cathy Maugis et Pierre Neuvial)

Analyse de données RNA-seq

• supports de cours pour “analyse de données RNA-seq” (formation PF biostatistique, Ignacio Gonzales, Annick Moisan et Nathalie Vialaneix) avec deux cas d’études complémentaires : TP1 et TP2

Langage de programmation R

• Initiation à R : support de cours de Sébastien Déjean avec des versions antérieures ici ici et ici (avec Thibaut Laurent) et supports de cours de Cathy Maugis-Rabusseau (comprenant Introduction, les bases, la statistique avec R et R avancé)
• Supports de cours pour « graphiques avancés avec R » (formation annuelle PF biostatistique) : Version 1 (Sébastien Déjean et Nathalie Vialaneix) et la version 2 (cours et TP) (Sébastien Déjean et Pierre Neuvial)
• initiation au tidyverse (Sébastien Déjean)
• initiation à shiny (Sébastien Déjean)
• tutoriel sur l’utilisation de R sur le cluster de la PF Bioinformatique de Toulouse (cluster slurm) (Gaëlle Lefort et Nathalie Vialaneix)