Initiation à l'analyse de données single-cell RNA-seq avec Seurat

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Description : La formation a pour but de vous familiariser avec les grandes étapes d’analyse de données single-cell RNA-seq et de les mettre en application à l’aide du package Seurat. Rem: cette formation est aussi une bonne base pour l’étude des données de Spatial Transcriptomics

Objectifs : A la fin de la formation, vous serez capable de mener une analyse de données single-cell RNA-seq avec Seurat.

Mots-clés : single-cell RNA-seq, clustering, marker genes, integration, Seurat

Notions abordées :

• Construction de l’objet Seurat
• Les grandes étapes du pipeline d’analyse de données single-cell RNA-seq
• Leur mise en application avec Seurat

Pré-requis : Avoir des bases de programmation avec R

Durée de la formation : 1,5 jours

Dates : 16 et 17 juin 2025

Lieu : INSA Toulouse Département Génie Mathématiques et Modélisation 135 avenue de Rangueil 31077 TOULOUSE